郭氏鉴于当时痧胀流行，采取前人有关经验。于康熙十四年（１６７５年）撰写《痧胀玉衡》一书共３卷，约７．９万字。上卷，载痧症发蒙论，玉衡要语列治痧三法，放痧有十、刮痧法、用针说、用药大法等专论治痧方法，玉衡脉法列唇舌辨、痧脉十二经辨、痧脉要诀、痧脉有似阴证辨、痧脉似气血有条辨、痧脉诀生死法等专论舌、脉诊法。中卷，叙述临床各种痧证的症状，并附以治疗验案，列遍身肿胀痧、伤风咳嗽痧，胎前产后痧、例经痧、眼目痧、瘟痧等４５种。下卷，载述治痧方药，共载汤、丸、丹、散剂５６方，另载便用方７首、绝痧方和治痧药物７０余种。到康熙十七年（１６７８年）郭氏从临床实践中认识到“痧之变幻，更有隐伏于别病中者”，乃撰成后卷。后卷，载述了痧胀看法，痧胀兼证及变证，列麻疹兼痧胀、痧胀兼麻疹、痧类阴证、呃逆痧、盘肠痧、口舌兼痧、筋骨疼痛痧等３７种。作者认为痧证之病因为天地间的戾气，为热毒之邪，可邻里相传。乡村城市之中，俱有此证，或为闷痧、或为痧痛，类型繁多；伤寒、疟疾、胎前、产后均可与痧兼发。痧毒自口鼻而入，或病于肌肤，或发于血肉，或发于胃肠经或肝脾肾三阴，均详述了各种痧证的临床症状和具体治疗方法。该书罗列冗繁，使人有无证不痧之感，此为书中不足之处，但仍可称之谓一部系统的痧证专著。
现存主要版本：清·康熙十四年刻本；日本·享保九年书肆竹田藤助刻本雷薄堂藏板；清刻本扫叶山房藏板；见《中国医学大成》本；１９５７年上海卫生出版社据《中国医学大成》本重印本。